Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms