Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPATO15228 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPATO15228 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPATO15228 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNPATO15228 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNPATO15228 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNPATO15228 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPATO15228 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms