Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOC4-APOC2K7ER74 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms