Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms