Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E9PBE3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E9PBE3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E9PBE3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E9PBE3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E9PBE3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E9PBE3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E9PBE3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E9PBE3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E9PBE3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E9PBE3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms