Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms