Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MCRIP1C9JLW8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCRIP1C9JLW8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms