Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms