Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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