Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms