Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms