Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNQ9UQP3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms