Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms