Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

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Length 1,477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN1Q9ULB1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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