Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms