Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms