Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms