Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms