Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms