Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms