Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms