Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms