Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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