Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms