Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HINT3Q9NQE9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms