Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms