Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLMPQ9H6B4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms