Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCSER1Q9C0I3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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