Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4CQ9C0C4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms