Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM55Q9BYV6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms