Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms