Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms