Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms