Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCMBPQ9BTE3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms