Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC22CQ9BRL7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms