Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF13CQ96RJ3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms