Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHIPQ96QV1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms