Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms