Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms