Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
YTHDC1Q96MU7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YTHDC1Q96MU7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms