Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP47Q96K76 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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