Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms