Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCMH1Q96GD3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms