Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms