Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC11Q96DB2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms