Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCTD12Q96CX2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms