Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTHRC1Q96CG8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTHRC1Q96CG8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms