Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms