Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC12Q8WUD4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms