Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX54Q8TDD1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms